Una volta che il polimero dell'antigene O è collegato al nucleo del lipide A, interromperà la reazione di polimerizzazione. Vale a dire, la reazione di connessione può terminare la reazione di polimerizzazione. Sia il nucleo del lipide A che il lipopolisaccaride con unità ripetute di lunghezza diversa possono essere efficacemente trasferiti alla membrana esterna. Pertanto, la dimensione molecolare del lipopolisaccaride può essere vista da SDS-PAGE, che è causata dalla differenza nel sistema di biosintesi piuttosto che dal fattore del sistema di output.

La distribuzione della catena laterale dell'antigene O in diversi batteri è diversa, alcuni dei quali contengono circa 20 unità ripetute e alcuni dei quali possono essere circa 100 unità ripetute. Nell'elettroforesi SDS-PAGE, si riflette la differenza nell'intensità della colorazione dell'argento di diverse molecole di diverse specie di batteri. La ragione della diversa distribuzione della lunghezza della catena laterale dell'antigene O in diversi batteri potrebbe essere che esiste un fattore di selezione delle dimensioni nel processo di policondensazione dell'antigene O o reazione di connessione. Wzz (cioè Rol o Cld) è un'importante proteina che regola la distribuzione della lunghezza della catena laterale nei batteri che sintetizzano gli antigeni attraverso la via Wzy dipendente, ma il suo meccanismo specifico non è ancora chiaro.